20. 8. 2021
ODPOVEDAN DOGODEK
Medicinska fakulteta Univerze v Ljubljani, v sodelovanju z Medicinsko Univerzo Graz in Katoliško Univerzo Leuven organizira
COGDEC POLETNO ŠOLO 2021
»Uporaba EEG in naprednih metod slikanja možganov«
ki bo potekala od 20. do 24. septembra 2021 v Ljubljani.
Poletna šola 2021 je del H2020 projekta COGDEC (Twinning), cilj katerega je prenos najnaprednejšega znanja na področju uporabe metod slikanja možganov iz dveh mednarodno priznanih raziskovalnih institucij.
Delavnica je namenjena diplomantom različnih ved (medicina, biologija, kemija, psihologija, matematika, fizika, informatika in kognitivna znanost) in bo prispevala k spoznavanju z Matlab orodji za analizo signalov EEG in ostalih naprednih metod slikanja možganov.
Predavatelji iz Medicinske fakultete Univerze v Ljubljani, Medicinske Univerze Graz in Katoliške Univerze Leuven bodo svoje znanje in izkušnje na področju preučevanja kognicije in analize podatkov, pridobljenih z različnimi tehnikami slikanja možganov (MR, EEG), predstavili na interaktivni delavnici, ki bo predvidoma potekala v živo v Ljubljani. V primeru slabih epidemioloških razmer in morebitnih omejitev v zvezi s širjenjem novega korona virusa bo delavnica izpeljana preko oddaljenega dostopa.
Teoretičnemu uvodu v uporabo in analizo podatkov pridobljenih z EEG in MR slikanji, bo za udeležence sledilo intenzivno praktično delo. Zadnji dan delavnice bo namenjen predstavitvi najnovejših dognanj in aktualnih projektov iz področja uporabe slikovnih metod za preučevanje možganov in kognicije.
Delavnica bo potekala v angleškem jeziku. Za računalniško in programsko opremo bo poskrbljeno. V primeru izvedbe delavnice preko oddaljenega dostopa bodo udeleženci potrebovali svoj računalnik in dobro internetno povezavo, podrobna navodila glede potrebne programske opreme, povezave, postopkov in ostalega bodo dobili pred delavnico.
Poletna šola 2021 je namenjena udeležencem, ki se:
a) želijo spoznati z MR in EEG metodami slikanja možganov, kot primarno metodo njihovega raziskovalnega dela za razumevanje mehanizmov kognicije in kognitivnega upada pri ljudeh;
b) želijo spoznati možnosti uporabe metod MR in EEG slikanja možganov, kot sekundarne, dopolnilne metode raziskovalne metode za razumevanje mehanizmov kognicije in kognitivnega upada pri ljudeh;
c) želijo spoznati povezavo med MR in EEG zaznanimi spremembami možganov in klinično oceno kognicije in kognitivnega upada pri ljudeh.
Pogoji za udeležbo na delavnici so:
a) zaključena 2. bolonjsko stopnjo študija ustrezne smeri (medicina, biologija, kemija, matematika, fizika, psihologija, informatika, kognitivna znanost, ali podobno);
b) upoštevane bodo le prijave udeležencev, ki še nimajo doseženega doktorata (vendar so lahko že vpisani v doktorski program) in imajo manj kot 4 leta izkušenj s polnim delovnim časom v raziskovalnem delu;
c) osnovno predznanje programskega jezika in okolja Matlab. Udeleženci, ki tega predznanja še nimajo, bodo pred začetkom delavnice lahko opravili začetni tečaj Matlaba, ki je dosegljiv na naslednji povezavi:
https://matlabacademy.mathworks.com/R2020b/portal.html?course=gettingstarted
d) pred začetkom delavnice bomo udeležence prosili, da nam posredujejo certifikat o opravljenem začetnem tečaju Matlab oziroma kratek opis preteklih izkušenj dela z Matlabom.
Vsem udeležencem bomo predhodno poslali tudi nekaj dodatnega gradiva (teoretične osnove področja, matlab skripte…) v povezavi s praktičnim delom delavnice.
Udeležba na poletni šoli je priznana kot izbirni predmet za študente interdisciplinarnega doktorskega študijskega programa Biomedicina in je ovrednotena 5 ECTS kreditnimi točkami.
Udeležba na delavnici je brezplačna. Število udeležencev je omejeno. Prijave sprejemamo do petka, 3. 9. 2021 na naslednji povezavi.
Za dodatna vprašanja smo vam na voljo preko e-maila: cogdec@mf.uni-lj.si
---------------------------- PRETEKLA PREDAVANJA IN DELAVNICE ----------------------------
24. 12. 2020
PRETEKLI DOGODEK
COGDEC ZIMSKA ŠOLA 2020
»Uporaba EEG in naprednih metod slikanja možganov«
je potekala od 14.-18. 12. 2020 v Ljubljani
V okviru projekta COGDEC, ki stremi k prenosu najnovejšega znanja na področju različnih tehnik slikanja možganov iz KU Leuven in MU Graz, smo sredi decembra izvedli 1. Cogdec Zimsko šolo z naslovom »Uporaba EEG in naprednih metod slikanja možganov«.
Cogdec Zimska šola je bila nadgradnja Poletne šole, ki je potekala junija 2020. Delavnica je bila v celoti izvedena preko spleta, saj trenutne epidemiološke razmere niso dovoljevale izvedbe v živo, kljub temu pa je njena interaktivna zasnova omogočila udeležencem, da so osvojili prve korake v Matlabu, vnadaljevanju pa so se lotili tudi kompleksnejših postopkov analize in grafičnega prikaza rezultatov.
Na delavnico je bilo prijavljenih 14 udeležencev iz Slovenije, Avstrije, Nemčije, Makedonije in Grčije. Med udeleženci je bilo tudi 5 študentov doktorskega programa Biomedicina, 5 študentov iz drugih doktorskih programov in 4 udeleženci, ki se o vpisu v doktorski program še odločajo. Udeleženci so prišli iz različnih področij, od medicine, kognitivne znanosti, športa, do psihologije in lingvistike.
Prvi dan so se udeleženci spoznali z osnovami Matlaba, v popoldanskem delu pa so že izvajali prve analize in grafične obdelave EEG podatkov. V drugem dnevu so se udeleženci spoprijeli s kompleksnejšimi nalogami obdelave podatkov, pri čemer so poglobili znanje vzorčenja, indeksiranja in prikaza možganske aktivnosti na podlagi EEG podatkov.
Preko osnov analize MRI podatkov z Matlabom, ki so jih udeleženci osvojili tretji dan, so se v 4. dnevu spoznali še z obdelavo T1 in T2* signala in analizo susceptibilno poudarjenega magnetnoresonančna slikanja (SWI).
Zadnji dan Zimske šole 2021 je s predavanji prof. dr. Dušana Šuputa (UL MF), doc. dr. Milice Gregorič Kramberger (UL MF/UKC), dr. Katarine Marjanovič (UL FF), izr. prof. dr. Maje Trošt (UL MF / UKC) in dr. Petre Tomše (UL FMF / UKC) postregel z vpogledom v aktualne raziskave na področju slikanja možganov, vsebino pa sta dopolnila tudi dr. Andrej Vovk in Matej Perovnik, ki sta pripravila poročilo izobraževanj v MU Graz in KU Leuven.
Tedenski program je bil vsebinsko zelo poln, pa tudi intenziven. Kljub zahtevnemu izobraževanju in obilici novih informacij, ki so jih udeleženci prejeli v 5-dneh šole, so bili končni vtisi zelo pozitivni. Udeleženci so pohvalili delo predavateljev in moderatorjev, ki so jih vodili in jim pomagali pri praktičnem delu ter izrazili željo po podobnih izobraževanjih tudi v prihodnje.
Naslednje izobraževanje v nizu dogodkov, ki jih organizira projektna ekipa Cogdec, bo Cogdec Poletna šola 2021, ki bo potekala med 20. in 24. septembrom 2021. Šola bo namenjena vsem, ki že imajo znanje in izušnje z delom v Matlabu (ali pa bodo pred dogodkom opravili osnovni tečaj iz Matlaba).
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
12. 7. 2020
PRETEKLI DOGODEK
COGDEC POLETNA ŠOLA 2020
»Uporaba EEG in naprednih metod slikanja možganov«
je potekala od 22.-26. 6. 2020 v Ljubljani
Med 22. in 26. junijem 2020 je pod okriljem projekta Cogdec, ki se izvaja na Medicinski fakulteti, potekala 1. Poletna šola z naslovom »Uporaba EEG in naprednih metod slikanja možganov«. Bistvo projekta Cogdec je omogočiti domačim raziskovalcem dostop do najnovejšega znanja na področju slikanja možganov, s posebnim poudarkom na spremljanju kognitivnih sprememb pri demenci, in okrepiti raziskovalno sodelovanje z dvema mednarodno priznanima raziskovalnima institucijama, Medicinsko univerzo Graz in Katoliško univerzo Leuven.
Poletna šola naj bi bila izvedena v prostorih Medicinske fakultete, s poudarkom na praktičnem delu, kjer bi udeleženci lahko dostopali tudi do sodobne opreme za slikanje možganov. Zaradi omejitev v zvezi z epidemijo Cov19 se je Organizacijski odbor projekta začetek aprila 2020 odločil, da Poletno šolo 2020 izvede preko oddaljenega dostopa. Poletna šola je bila tako v celoti izvedena preko spleta, pri čemer je udeležencem ponudila tako predavanja z možnostjo diskusije kot tudi interaktivno skupinsko delo na konkretnih nalogah.
Poletne šole se je udeležilo 14 udeležencev, od tega 10 doktorandov in 4 študenti, ki se o vpisu na doktorski študij še odločajo. V potek predavanj in praktičnega dela je bilo vključenih več kot 15 oseb, ki so poskrbele tako za tehnično in vsebinsko izvedbo kot tudi za to, da je bilo udeležencem na interaktiven in dinamičen način posredovano najnovejše znanje iz področja metod slikanja možganov. V anketi so udeleženci omenili kot največjo pomanjkljivost izvedbe preko oddaljenega dostopa odsotnost osebnega stika in povezovanja, kljub temu pa so končani šoli izrazili veliko zadovoljstvo nad kvaliteto izvedbe in pridobljenim znanjem.
Poletno šolo je s sodelavcem Jako Bonom in sodelavko Tino Štukelj vodil prof. dr. Samo Ribarič, koordinator projekta Cogdec (Horizon 2020, Twinning). Poleg priznanih tujih predavateljev, prof. dr. Marca Van Hulleja in dr. Elvire Khachatryan iz KU Leuven ter prof. dr. Stefana Ropela iz MU Graz, so svoje znanje z udeleženci na prvi dan dogodka delili tudi domači strokovnjaki iz tega področja prof. dr. Zvezdan Pirtošek, prof. dr. Grega Repovš, izr. prof. dr. Maja Trošt in doc. dr. Milica Gregorič Kramberger.
Drugi (23.6.2020) in tretji dan (24.6.2020) sta bila namenjena praktičnemu spoznavanju z MRI in EEG. Uvodnemu predavanju drugega dne, ki ga je imel prof. dr. Stefan Ropele iz MU Graz, sta sledila dva praktikuma, pri čemer so se udeleženci spoznali z DICOM formatom in skupaj pripravili raziskovalni protokol za klinično študijo preučevanja Alzheimerjeve bolezni s pomočjo MRI. Tretji dan Poletne šole je s svojim predavanjem začela dr. Elvira Khachatryan iz KU Leuven, v nadaljevanju pa sta udeležence skozi dva praktikuma vodila njena sodelavca Mansoureh Fahimi Hnazaee in Arno Libert. Udeleženci so se spoznali z vajami iz lokalizacije izvora ter predprocesiranja zaznanih signalov.
Na prazničen četrtek, 25.6.2020 so bila na vrsti predavanja, ki so udeležencem prinesla še nekaj dodatnih informacij in znanj na področju slikovnih metod ter tudi vpogled v aktualne novosti in raziskovalne projekte na področju metod slikanja možganov in upada kognicije/demence, ki so v teku tako v Sloveniji kot tudi v tujini. Svoj prispevek so imeli prof. dr. Dušan Šuput in dr. Andrej Vovk (oba UL MF), dr. Uroš Marušič (ZRS Koper), Andraž Matkovič in Aleksij Kraljič (oba UL FF) ter dr. Petra Tomše (UKC Ljubljana).
Zadnji dan dogodka je bil namenjen vrednotenju in načrtom za prihodnja Cogdec izobraževanja ter tudi za pogovor s kandidati glede možnih sodelovanj v prihodnosti, kamor spadajo tako raziskovalno delo v obliki doktorata kot sodelovanje pri tekočih raziskavah.
Naslednja iz vrste mednarodnih COGDEC izobraževanj v sodelovanju s KU Leuven in MU Graz bo Zimska šola 2020, ki bo potekala med 14. in 18. decembrom 2020 v prostorih Medicinske fakultete. Program zimske poletne šole bo objavljen septembra, del praktičnega usposabljanja pa bo potekal tudi v MRI in EEG laboratoriju.
PROGRAM COGDEC Poletne šole 2020
